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【學術報告】生態環境學院學術報告通知
2019-12-17 17:34   生態環境學院 審核人:   (點擊: )

報告一:

報告題目:蛋白質組大數據和人工智能的臨床應用

報告人:郭天南研究員

報告時間:2019年12月18日(周三)下午14:00

報告地點:數字化大樓A座303會議室

報告摘要:

近年來,多項技術創新推動蛋白質組學經歷著深刻的變革。蛋白質組分析的通量在近5年提高了10倍以上,所需的樣本量降低了10倍以上,單個蛋白質組實驗包含的樣本數量達到百和千的級別,每個樣本中被檢測到的蛋白質數量也增加了至少2倍。高通量蛋白質組技術的進步驅動了越來越多的臨床樣本的蛋白質組被檢測,并與其基因組和轉錄組進行綜合分析,以期對疾病診療的更為精準的指導。這里,我會跟大家具體探討蛋白質組大數據的方法學進展以及其結合人工智能,在醫學中的應用。


個人簡介:

郭天南,西湖大學特聘研究員。主要研究方向蛋白質組大數據。郵箱:[email protected]。2006年畢業于華中科技大學同濟醫學院臨床醫學七年制,同時獲得武漢大學生物科學雙學位。2012年獲得新加坡南洋理工大學博士學位。2012-2017年在瑞士蘇黎世聯邦理工大學Ruedi Aebersold教授實驗室從事博士后研究。2017年初在澳大利亞悉尼大學兒童醫學研究所ProCan任Scientific Director,腫瘤蛋白質組Group Leader,悉尼大學醫學院兼聘高級講師。2017年8月加入西湖高等研究院任特聘研究員。長期從事蛋白質組學相關研究,在蛋白質組技術開發和臨床應用上做出多項原創性技術成果。建立了一套獨特的高通量臨床蛋白質組方法學(高壓循環-衛星掃描質譜技術,PCT-SWATH),解決了將蛋白質組學實際應用于醫學臨床檢驗的一個核心技術難題,實現了對小量臨床樣本的高重復性高通量的質譜分析,并將其應用于大量的臨床樣本(包括甲狀腺癌、前列腺癌、腎癌等),結合人工智能探索生物標志物。近5年以第一作者或通訊作者在Nature Medicine,Nature Comm,Mol Oncology等發表多篇論文。更多信息請參考www.guomics.com。

報告二:

報告題目:單細胞技術解析渦蟲再生的細胞及分子機制

報告人:曾安研究員

報告時間:2019年12月18日(周三)下午14:00

報告地點:數字化大樓A座303會議室

報告摘要:

探究如何讓衰老或損傷的機體再生出新的功能性組織或細胞是發育生物學和再生醫學中的重要問題。為了研究再生的生物學機制,我們選擇淡水渦蟲(Planarian)作為研究模型。渦蟲具有強大的再生能力,其身體任意片段被切割后,都能再生出完整的個體。長期以來,維持渦蟲無限再生能力的細胞類型并不清楚。我們前期工作結合基因組學、單細胞分析、流式細胞術和成像技術,鑒定并分離了渦蟲無限再生能力的細胞來源--成體存在的一群多能性干細胞。我們發現,這群干細胞可以在單細胞移植實驗中分化形成所有其他細胞類型,并重建整個渦蟲。這個發現更新了領域內對渦蟲干細胞組成和身份的認知,揭示了渦蟲無限再生能力的細胞學基礎。這個發現可能促進對渦蟲等具有較強再生能力的有機體開展生物研究,而且有助于對人類等具有較低再生能力的有機體開展再生醫學研究。

個人簡介:

曾安,中國科學院生物化學與細胞生物學研究所研究員。研究興趣:組織器官再生。

2013年博士畢業于中科院上海生科院。2013年至2019年于美國斯托瓦斯醫學研究所(Stowers Institute)任博士后研究員,導師為美國科學院院士、HHMI研究員Alejandro Sánchez Alvarado教授。自2006年起在國內建立地中海渦蟲(Schmidtea mediterranea)研究體系用于組織器官再生的機制研究。主要研究方向是利用渦蟲(planarian)等為模式生物,研究組織器官再生的細胞及分子學基礎。主要研究貢獻:1)揭示組織干細胞參與渦蟲再生的表觀遺傳學調控機理(2013,JCB); 2)利用大規模單細胞基因表達分析技術,結合單細胞分選、單細胞移植等實驗手段,揭示了渦蟲無限再生能力的細胞起源(2018,Cell)。曾獲得2013年中國科學院院長獎優秀獎,2012年美國Keystone Symposia會議Future of Science Fund獎學金等。

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